新疆各类湿地148.35万ha（包括水稻田6.40万ha），其中河流湿地45个20.57万ha、湖泊湿地108个69.69万ha、沼泽湿地148个36.93万ha、库塘湿地134个14.76万ha。其中，自然湿地127.19万ha，占国土面积的0.76%，中国湿地的平均比重高于新疆湿地比重的近4倍；加库塘湿地14.76万ha共141.95万ha，占国土面积的0.85%；再加水稻田湿地6.40万ha共148.35万ha，占国土面积的0.89%。新疆湿地的垂直分布从－155m至山地4 800m，形成了复杂多样的内陆湿地生态系统，与沿海地区和中部地区相比，有一定的特色，主要是孤岛性、多变性、富营养、矿化度高、原生湿地的特征减弱或消失等特点。
    新疆湿地比重虽然远低于中国的平均水准，但是，新疆在西北湿地比重较高，列入中国重点湿地也较多，到2007年，列为国家重点保护湿地名录有22个。其中以沼泽的1个，以河流的5个，以湖泊的16个。
    新疆湿地面积主要分布在巴音郭楞蒙古自治州、博尔塔拉蒙古自治州、阿勒泰地区，分别占新疆湿地面积的39.43%、13.64%、11.22%。3个地州占新疆湿地面积的61%以上。喀什地区、阿克苏地区、和田地区、塔城地区占4.54%～2.17%；、哈密地区、伊犁哈萨克自治州直属县市、克孜勒苏柯尔克孜自治州、克拉玛依市、昌吉回族自治州、吐鲁番地区占1.74%～0.48%。从湿地在各地区分布状况可以看出，湿地主要分布于塔里木河流域、阿勒泰地区和博尔塔拉蒙古自治州。